马昕

发布者:统计与数据科学学院发布时间:2017-03-07浏览次数:4684

 

南京审计大学统计与数据科学学院

马昕   中共党员

 

最后学位:东南大学工学博士

岗位职称:教授                           

   

研究领域:生物信息学

 

办公室:位育楼412

  Emai l :maxin@nau.edu.cn

通讯地址:南京市浦口区雨山西路86号

  编:211815

   

学习简历                                                                                 

  1999.09 – 2003.06 苏州大学数学科学学院 数学与应用数学专业 理学学士

  2003.09 – 2006.06 苏州大学数学科学学院 应用数学专业 理学硕士

  2008.09 – 2012.09 东南大学生物医学工程学院 生物医学工程专业 工学博士

   

工作简历                                                                                 

  2006.06 - 2008.10南京审计大学助教

  2008.10-2014.07南京审计大学     讲师

  2014.07 –2021.07南京审计大学     副教授

2021.07-至今 南京审计大学     教授

   

教学课程:

本科生课程:概率论、数理统计、概率论与数理统计、线性代数

研究生课程:机器学习与数据挖掘、统计机器学习

 

主持参与课题 

 

1. DNA\RNA相互结合的蛋白质预测与统计分析,国家自然科学基金,项目批准号:61305072(主持人)

2. 基于机器学习算法的SmallRNA-结合位点预测,江苏省高校自然科学研究计划项目,项目批准号:14KJB520020(主持人)

3. 基于序列的蛋白质与DNA相互作用的预测研究,江苏省高校自然科学研究计划项目,项目批准号:12KJD520006(主持人)

4. 支持向量机和随机森林算法在海量数据分析中的应用,南京审计大学校级课题,项目批准号:NSK2009/01(主持人)

5. 人类基因组遗传变异与核小体定位的相互作用研究,国家自然科学基金,项目批准号:31240080(主要参与)

6.核小体定位的动态调控信息分析,国家自然科学基金,项目批准号:61073141(主要参与)

7. 基于审计大数据分析的统计过程控制研究,国家社会科学基金项目,项目批准号:20BTJ057(主要参与)

8. 面向文本标准化事件抽取的自适应迁移学习研究,江苏省自然科学基金面上项目,项目批准号:BK2171495(主要参与)

9. 动态核小体定位及其在癌细胞中的基因调节作用研究,江苏省自然科学基金面上项目,项目批准号:BK2010406(主要参与)

10. 云制造环境下约束多模式项目调度优化方法,江苏省高校自然科学研究计划项目,项目批准号:15KJB520021(主要参加)

 

 

发表论文 

1. Xin Ma*, Jing Guo and Xiao Sun, Prediction of microRNA-binding residues in protein using a Laplacian support vector machine based on sequence informationJournal of bioinformatics and computational biology163:132018. (SCI)

2. 马昕*,王雪,基于Laplacian支持向量机和序列信息的microRNA-结合残基预测,马昕,王雪,山东大学学报.工学版5002:76-822020.(北大核心)

3. Xin Ma*, Jing Guo and Xiao Sun, DNABP: Identification of DNA-binding proteins based Xin Ma*, Jing Guo and Xiao Sun on feature selection using a random forest and predicting binding residues, PLoS ONE, 11(12):e0167345, 2016. (SCI)

4. Xin Ma*, Jing Guo, Ke Xiao and Xiao Sun, PRBP: Prediction of RNA-binding proteins using a random forest algorithm combined with an RNA-binding residue predictor,IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics,12(6), 1385-1393,2015. (SCI)

5. Xin Ma*, Jing Guo and Xiao Sun, Sequence-Based Prediction of RNA-Binding Proteins Using Random Forest with Minimum Redundancy Maximum Relevance Feature Selection,BioMed Research International, volume 2015, Article ID 425810, 10 page,http://dx.doi.org/10.1155/2015/425810, 2015. (SCI)

6. Xin Ma* and Xiao Sun, Sequence-based predictor of ATP-binding residues using random forest and mRMR-IFS feature selection, Journal of Theoretical Biology, 360: 59-66, 2014. (SCI)

7.  Xin Ma*, Jiansheng Wu and Xiaoyun Xue, Identification of DNA-binding proteins using support vector machine with sequence information, Computational and Mathematical Methods in Medicine,2013:524502, doi: 10.1155/2013/524502, 2013. (SCI)

8. Xin Ma, Jing Guo, Hongde Liu, Jianming Xie and Xiao Sun*, Sequence-based prediction of DNA-binding residues in proteins with conservation and correlation information, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 41(2), 213-224, 2012. (SCI)

9. Xin Ma, Jing Guo, Jiansheng Wu, Hongde Liu, Jiafeng Yu, Jianming Xie and Xiao Sun*, Prediction of RNA-binding residues in proteins from primary sequence using an enriched random forest model with a novel hybrid feature,Proteins, 79(4), 1230-1239, 2011.(SCI)

10. 马昕,郭静,孙啸*,蛋白质中RNA-结合残基预测的随机森林模型,东南大学学报(自然科学版),42(1),50-54,2012. (EI)

11. Shenglei Chen, Geoffrey I. Webb, Linyuan Liu, Xin Ma, A novel selective naïve Bayes algorithm. Knowledge-Based Systems, 192: 105361, 2020. (SCI)

12. Hongde Liu*, Kun Luo, Hao Wen, Xin Ma, Jianming Xie andXiao Sun, Quantitative analysis reveals increased histone modifications and a broad nucleosome-free region bound by histone acetylases in highly expressed genes in human CD4(+) T cell, Genomics, 101(2), 113-119. 2013. (SCI)

13. Changchang Cao,Cheng Li,Zheng Huang,Xin Ma andXiao Sun*, Identifying rare variants with optimal depth of coverage and cost-effective overlapping pool sequencing, Genetic epidemiology, 37(8), 820-30, 2013. (SCI)

14. 刘宏德,张德金,谢建明,袁志栋,马昕,卢志远,龚乐君,孙啸,miRNA基因和编码基因启动子区核小体定位分析,科学通报,55(14),1335-1340,2010. (SCI)

15. 刘宏德,罗坤,马昕,翟金城,谢建明,孙啸,万亚坤,核小体及染色质修饰的基因组分布模式和染色质状态,生物化学与生物物理进展, 40(11): 1088-1099,2013. (SCI)

 

 

教学和科研获奖 

1. 江苏省高校大学数学课程教学创新大赛一等奖, 2021

2  江苏省高校微课教学比赛二等奖2020

3  江苏省高校第二届数学微课程教学竞赛二等奖,2020

4  江苏省高校微课教学比赛三等奖2019

5  江苏省高校首届数学微课程教学竞赛三等奖,2018

6  江苏省青蓝工程优秀青年骨干教师2014

7  江苏省第四届高校数学基础课青年教师授课竞赛三等奖,2015

8  南京审计大学首届教师教学创新大赛一等奖,2021

9  南京审计大学第七届微课教学比赛一等奖,2020

10  南京审计大学第六届微课教学比赛一等奖,2019

11 南京审计大学第五届微课教学比赛一等奖,2018

12  南审好课堂二等奖,2020